Multinomiale logistische regressie: Difference between revisions
No edit summary |
No edit summary |
||
(4 intermediate revisions by 2 users not shown) | |||
Line 1: | Line 1: | ||
Een multinomiaal | Een multinomiaal logistisch regressiemodel wordt gebruikt om het effect van voorspellers op een nominale uitkomstmaat te analyseren. De uitkomstmaat bestaat dus uit (meer dan twee) categorieën die geen logische ordening hebben, bijvoorbeeld in een onderzoek naar voorspellers van de gekozen behandeling bij hartpatiënten, waarbij er drie opties zijn: 'PTCA', 'Bypass surgery' of 'Medication only'. | ||
== Hebben wij een multinomiaal logistisch regressiemodel nodig?== | == Hebben wij een multinomiaal logistisch regressiemodel nodig?== | ||
''We hebben een ordinale uitkomstmaat (tumorgraad 1,2 | ''We hebben een ordinale uitkomstmaat (tumorgraad 1,2 of 3) en een lineaire continue voorspeller (attenuatiecoëfficiënt). Wij zouden graag een model ontwikkelen om op basis van de bekende attenuatiecoëfficiënt te kunnen bepalen in welke categorie of graad deze tumor zal vallen. Onze gedachte was dat we hiervoor een multinomiale logistische regressie moeten doen. Is dat juist en zijn er ook andere mogelijkheden? | ||
deze tumor zal vallen. Onze gedachte was dat we hiervoor een multinomiale logistische | |||
regressie moeten doen. Is dat juist en zijn er ook andere mogelijkheden? | |||
Het is inderdaad mogelijk om met een multinomiaal logistisch regressiemodel het mogelijke effect van een continue voorspeller op een ordinale uitkomstmaat te analyseren. Let wel op het volgende: dit model houdt geen rekening met de geordendheid van de | Het is inderdaad mogelijk om met een multinomiaal logistisch regressiemodel het mogelijke effect van een continue voorspeller op een ordinale uitkomstmaat te analyseren. Let wel op het volgende: dit model houdt geen rekening met de geordendheid van de categorieën. De tumorgraad 1 2 3 zou dus bij wijze van spreken ook rood groen blauw kunnen heten, zonder duidelijke volgorde. Indien het model graad 2 voorspelt i.p.v. graad 3 is dit "evenveel fout" als het voorspellen van graad 1 i.p.v. graad 3. Om ook met de geordendheid van de categorieën rekening te houden, zou je een [[ordinale logistische regressie]] kunnen doen. | ||
Bij beide modellen echter blijven de geschatte parameters altijd wat ver afstaan van de "klinische interpretatie" van het probleem. Jullie zouden daarom ook kunnen overwegen de assen om te draaien en -bijvoorbeeld in een (boxplotachtige) grafiek- de | Bij beide modellen echter blijven de geschatte parameters altijd wat ver afstaan van de "klinische interpretatie" van het probleem. Jullie zouden daarom ook kunnen overwegen de assen om te draaien en -bijvoorbeeld in een (boxplotachtige) grafiek- de attenuatiecoëfficiënt uit te zetten voor de drie verschillende groepen. Daarbij zou je met een [[One-way ANOVA|ANOVA]] / [[Kruskal Wallis]] het verschil tussen de drie groepen aan kunnen geven. Deze aanpak draait de relatie in zeker opzicht om, het berekent namelijk het verschil veroorzaakt door de tumorgroep in de uitkomstmaat attenuatiecoëfficiënt. Maar de analysemethode is wel een stuk helderder/bekender. Let op: je loopt met deze aanpak vast als je ook andere voorspellers dan attenuatiecoëfficiënt wilt meenemen in het model. | ||
== Waar vind ik multinomiale logistische regressie in SPSS? == | == Waar vind ik multinomiale logistische regressie in SPSS? == | ||
Je vindt multinomiale logistische regressie in SPSS onder Analyze -> Regression -> Multinomial Logistic. Zie bijvoorbeeld deze [ | Je vindt multinomiale logistische regressie in SPSS onder Analyze -> Regression -> Multinomial Logistic. Zie bijvoorbeeld deze [https://stats.idre.ucla.edu/spss/output/multinomial-logistic-regression/ annotated output] van de UCLA voor uitleg hoe de output van deze procedure te interpreteren. | ||
== Hoe voer ik multinomiale logistische regressie uit in [[Statistische_software#R|R]]? == | == Hoe voer ik multinomiale logistische regressie uit in [[Statistische_software#R|R]]? == | ||
Line 19: | Line 17: | ||
In [[Statistische_software#R|R]] kun je voor het uitvoeren van een multinomiale logistische regressie bijvoorbeeld gebruik maken van de functie 'multinom' in de package 'nnet'. | In [[Statistische_software#R|R]] kun je voor het uitvoeren van een multinomiale logistische regressie bijvoorbeeld gebruik maken van de functie 'multinom' in de package 'nnet'. | ||
{{onderschrift}} | |||
Latest revision as of 10:07, 24 June 2024
Een multinomiaal logistisch regressiemodel wordt gebruikt om het effect van voorspellers op een nominale uitkomstmaat te analyseren. De uitkomstmaat bestaat dus uit (meer dan twee) categorieën die geen logische ordening hebben, bijvoorbeeld in een onderzoek naar voorspellers van de gekozen behandeling bij hartpatiënten, waarbij er drie opties zijn: 'PTCA', 'Bypass surgery' of 'Medication only'.
Hebben wij een multinomiaal logistisch regressiemodel nodig?
We hebben een ordinale uitkomstmaat (tumorgraad 1,2 of 3) en een lineaire continue voorspeller (attenuatiecoëfficiënt). Wij zouden graag een model ontwikkelen om op basis van de bekende attenuatiecoëfficiënt te kunnen bepalen in welke categorie of graad deze tumor zal vallen. Onze gedachte was dat we hiervoor een multinomiale logistische regressie moeten doen. Is dat juist en zijn er ook andere mogelijkheden?
Het is inderdaad mogelijk om met een multinomiaal logistisch regressiemodel het mogelijke effect van een continue voorspeller op een ordinale uitkomstmaat te analyseren. Let wel op het volgende: dit model houdt geen rekening met de geordendheid van de categorieën. De tumorgraad 1 2 3 zou dus bij wijze van spreken ook rood groen blauw kunnen heten, zonder duidelijke volgorde. Indien het model graad 2 voorspelt i.p.v. graad 3 is dit "evenveel fout" als het voorspellen van graad 1 i.p.v. graad 3. Om ook met de geordendheid van de categorieën rekening te houden, zou je een ordinale logistische regressie kunnen doen.
Bij beide modellen echter blijven de geschatte parameters altijd wat ver afstaan van de "klinische interpretatie" van het probleem. Jullie zouden daarom ook kunnen overwegen de assen om te draaien en -bijvoorbeeld in een (boxplotachtige) grafiek- de attenuatiecoëfficiënt uit te zetten voor de drie verschillende groepen. Daarbij zou je met een ANOVA / Kruskal Wallis het verschil tussen de drie groepen aan kunnen geven. Deze aanpak draait de relatie in zeker opzicht om, het berekent namelijk het verschil veroorzaakt door de tumorgroep in de uitkomstmaat attenuatiecoëfficiënt. Maar de analysemethode is wel een stuk helderder/bekender. Let op: je loopt met deze aanpak vast als je ook andere voorspellers dan attenuatiecoëfficiënt wilt meenemen in het model.
Waar vind ik multinomiale logistische regressie in SPSS?
Je vindt multinomiale logistische regressie in SPSS onder Analyze -> Regression -> Multinomial Logistic. Zie bijvoorbeeld deze annotated output van de UCLA voor uitleg hoe de output van deze procedure te interpreteren.
Hoe voer ik multinomiale logistische regressie uit in R?
In R kun je voor het uitvoeren van een multinomiale logistische regressie bijvoorbeeld gebruik maken van de functie 'multinom' in de package 'nnet'.
Klaar met lezen? Je kunt naar het OVERZICHT van alle statistische onderwerpen op deze wiki gaan of naar de pagina KEUZE TOETS voor hulp bij het uitzoeken van een geschikte toets of analyse. Wil je meer leren over biostatistiek? Volg dan de AMC e-learning Practical Biostatistics. Vind je op deze pagina's iets dat niet klopt? Werkt een link niet? Of wil je bijdragen aan de wiki? Neem dan contact met ons op.
De wiki biostatistiek is een initiatief van de voormalige helpdesk statistiek van Amsterdam UMC, locatie AMC. Medewerkers van Amsterdam UMC kunnen via intranet ondersteuning aanvragen.