Meta-analyse: Difference between revisions

From Wikistatistiek
Jump to navigation Jump to search
(Veel toevoegen)
Line 1: Line 1:
In een meta-analyse worden resultaten van studies samengevoegd om tot een meer betrouwbare uitspraak te komen.
In een meta-analyse worden resultaten van studies samengevoegd om tot een meer betrouwbare uitspraak te komen. Voor vragen over het uitvoeren van een meta-analyse verwijzen wij naar het [http://www.cochrane.nl/nl/index.html Dutch Cochrane Centre].  
 
Voor vragen over het uitvoeren van een meta-analyse verwijzen wij naar het [http://www.cochrane.nl/nl/index.html Dutch Cochrane Centre].  


== Wat is het verschil tussen een meta-analyse en een systematic review? ==
== Wat is het verschil tussen een meta-analyse en een systematic review? ==


De term 'systematic review' heeft vooral van doen met het systemetisch literatuur zoeken, beoordelen, en beschrijven. Zie ook de [http://dcc.cochrane.org/nl/veelgestelde-vragen#2%20wat%20is%20SR site van het Dutch Cochrane Centre].
De term 'systematic review' heeft vooral van doen met het systematisch literatuur zoeken, beoordelen en beschrijven. Zie ook de [http://dcc.cochrane.org/nl/veelgestelde-vragen veelgestelde vragen] van het Dutch Cochrane Centre.


Een meta-analyse is een statistische analyse waarbij de (samengevatte) resultaten van verschillende studies gecombineerd worden tot een 'overall' resultaat. Dit heeft dus meer te maken met het doen van bepaalde berekeningen waarbij de resultaten van ieder van de gevonden studies input is.  
Een meta-analyse is een statistische analyse waarbij de (samengevatte) resultaten van verschillende studies gecombineerd worden tot een 'overall' resultaat. Dit heeft dus meer te maken met het doen van bepaalde berekeningen waarbij de resultaten van ieder van de gevonden studies input is.  
Soms worden de studieresultaten van verschillende studies gecombineerd waarbij er van iedere studie niet de (samengevatte) resultaten als input dienen, maar waarbij er van iedere studie van iedere patient informatie is. Het poolen van dergelijke per-patient data wordt aangeduidt als 'individual patient data (IPD) meta-analysis.
Soms worden de studieresultaten van verschillende studies gecombineerd waarbij er van iedere studie niet de (samengevatte) resultaten als input dienen, maar waarbij er van iedere studie van iedere patient informatie is. Het poolen van dergelijke per-patient data wordt aangeduidt als 'individual patient data (IPD) meta-analysis.
== Welke software kan ik gebruiken om een meta-analyse uit te voeren? ==
De algemene pakketten om statistische analyses uit te voeren bieden in het algemeen geen voorgeprogrammeerde routines om meta-analyses uit te voeren. SPSS heeft geen voorgeprogrammeerde routines om meta-analyses uit te voeren. Op internet kom je verschillende syntax bestanden en macro's voor SPSS en Excel tegen. Het is moeilijk om te beoordelen of deze de benodigde parameters op de juiste manier berekenen. STATA heeft geen meta-analyse command, maar gebruikers van dit pakket hebben diverse packages hiervoor geschreven. Je kunt op de [http://www.stata.com/support/faqs/statistics/meta-analysis/ STATA website] meer hierover lezen. Er zijn diverse packages voor R om meta-analyses uit te voeren. Een goede beginpunt is de [http://cran.r-project.org/web/views/MetaAnalysis.html CRAN task view meta-analysis].
Er zijn ook diverse programma's die gericht zijn op het uitvoeren van een meta-analyse. [http://tech.cochrane.org/revman Review Manager (RevMan)] is een programma ontworpen om een Cochrane Review te schrijven en onthouden. Hiermee kan je verschillende typen meta-analyses uitvoeren.


== Ik wil de prevalentie (1 arm) over verschillende studies poolen, welke software is hiervoor beschikbaar?==
== Ik wil de prevalentie (1 arm) over verschillende studies poolen, welke software is hiervoor beschikbaar?==
Line 48: Line 52:
* [http://www.psychwiki.com/wiki/Meta-analysis Psych-wiki.com - Meta-analysis]
* [http://www.psychwiki.com/wiki/Meta-analysis Psych-wiki.com - Meta-analysis]
* [http://www3.interscience.wiley.com/cgi-bin/fulltext/93521074/PDFSTART Thompson SG, Higgins JPT, How should meta-regression analyses be undertaken and interpreted? Stat Med. 2002 Jun 15;21(11):1559-73.]
* [http://www3.interscience.wiley.com/cgi-bin/fulltext/93521074/PDFSTART Thompson SG, Higgins JPT, How should meta-regression analyses be undertaken and interpreted? Stat Med. 2002 Jun 15;21(11):1559-73.]


{{onderschrift}}
{{onderschrift}}

Revision as of 15:39, 3 July 2015

In een meta-analyse worden resultaten van studies samengevoegd om tot een meer betrouwbare uitspraak te komen. Voor vragen over het uitvoeren van een meta-analyse verwijzen wij naar het Dutch Cochrane Centre.

Wat is het verschil tussen een meta-analyse en een systematic review?

De term 'systematic review' heeft vooral van doen met het systematisch literatuur zoeken, beoordelen en beschrijven. Zie ook de veelgestelde vragen van het Dutch Cochrane Centre.

Een meta-analyse is een statistische analyse waarbij de (samengevatte) resultaten van verschillende studies gecombineerd worden tot een 'overall' resultaat. Dit heeft dus meer te maken met het doen van bepaalde berekeningen waarbij de resultaten van ieder van de gevonden studies input is. Soms worden de studieresultaten van verschillende studies gecombineerd waarbij er van iedere studie niet de (samengevatte) resultaten als input dienen, maar waarbij er van iedere studie van iedere patient informatie is. Het poolen van dergelijke per-patient data wordt aangeduidt als 'individual patient data (IPD) meta-analysis.

Welke software kan ik gebruiken om een meta-analyse uit te voeren?

De algemene pakketten om statistische analyses uit te voeren bieden in het algemeen geen voorgeprogrammeerde routines om meta-analyses uit te voeren. SPSS heeft geen voorgeprogrammeerde routines om meta-analyses uit te voeren. Op internet kom je verschillende syntax bestanden en macro's voor SPSS en Excel tegen. Het is moeilijk om te beoordelen of deze de benodigde parameters op de juiste manier berekenen. STATA heeft geen meta-analyse command, maar gebruikers van dit pakket hebben diverse packages hiervoor geschreven. Je kunt op de STATA website meer hierover lezen. Er zijn diverse packages voor R om meta-analyses uit te voeren. Een goede beginpunt is de CRAN task view meta-analysis.

Er zijn ook diverse programma's die gericht zijn op het uitvoeren van een meta-analyse. Review Manager (RevMan) is een programma ontworpen om een Cochrane Review te schrijven en onthouden. Hiermee kan je verschillende typen meta-analyses uitvoeren.


Ik wil de prevalentie (1 arm) over verschillende studies poolen, welke software is hiervoor beschikbaar?

Je kunt deze analyse uitvoeren in R gebruik makend van de metaprop functie uit de package meta.

Hoe kan ik de mean en sd van een behandel- en een controlegroep poolen om mean en sd van beide groepen samen te krijgen?

Voor een review wil ik voor een overzicht van de geincludeerde artikelen de mean en SD van de gehele studie populatie beschrijven. In de artikelen staat echter vaak een aparte mean en SD voor de behandel- en een voor de controlegroep. Hoe kan ik hiermee een mean/SD van de gehele studiepopulatie berekenen?

Stel we noemen de mean en standaard deviatie van de controlegroep m1, s1 en de mean en standaard deviatie van de behandelgroep m2, s2. Zeg dat de controle groep n_1 patienten bevat en de behandelgroep n_2. De mean van de twee groepen samen (m) is dan simpel een gewogen gemiddelde van de twee means:

m = (n1*m1+n2*m2)/(n1+n2)

Voor het berekenen van de gepoolde standaarddeviatie (sd) is meer nodig. Hiervoor kun je de volgende formules aanhouden. Hier noteren we de variantie in beide groepen als var1=s1^2, var2=s2^2

var = (n1*var1+n2*var2+n1*(m1-m)^2+n2*(m2-m)^2)/(n1+n2)

sd = wortel(var)

Hoe kan ik twee gepaarde gemiddeldes beschreven in verschillende studies vergelijken?

Voor een systematic review over een bepaalde chirurgische ingreep heb ik data verzameld uit 5 publicaties. Door deze ingreep neemt de hypertrofie, uitgedrukt in gram, een continue variabele af. In deze 5 studies is de gemiddeld preoperatieve hypertrofie bekend met een standaard deviatie. Ook de gemiddelde hypertrofie na follow-up is bekend, ook met standaard deviatie. Alle studies laten een afname in de gemiddelde hypertrofie zien na de ingreep. Nu vragen wij ons af of het mogelijk is om aan te geven of de afname significant is. Ik denk dat ik de ruwe data zou moeten hebben zodat ik een paired t-test kan doen. De ruwe data heb ik echter niet. Hoe kan ik de afname gerapporteerd in de verschillende studies testen?

Om hier een formele toets op te kunnen doen, is er naast de gemiddelde + sd preoperatief en na follow up inderdaad nog extra informatie nodig. Door het gepaarde design heb je gegevens nodig over de mate van correlatie tussen de voor en de nameting. Je zou dat af kunnen leiden als de artikelen bovenop de genoemde mean en sd’s nog een van de volgende zaken vermelden:

- gemiddeld verschil tussen voor en na + sd of se

- of: toetsresultaat, bijv een paired t-test: t-statistic of p-waarde is voldoende

Zie ook Deel 16.1.3.2 van het Cochrane handboek voor verdere uitleg. De paired t-test kan inderdaad niet. Een mogelijke analyse zou een meta-analyse zijn op basis van changes + sd’s (die je dus eventueel kunt afleiden uit se’s of gepaarde test statistics).

Referenties

  • MetaAnalyst Windows-gebaseerd programma voor het uitvoeren van meta-analyse. Zeer gebruiksvriendelijke interface. Let wel: enkele methodes zijn nog in testfase (zie tab 'features'). Voor installatie is 1 extra stap nodig:

"The operating system, being European, wants to use commas instead of decimals. It will have trouble parsing the conf file. Please go to the MetaAnalyst directory (e.g., C:\Program Files\MetaAnalyst) and open the file "ma.conf" in any text editor (e.g., notepad). Where it now reads: "ci = .95" change it to: "ci = ,95". Save the file as ma.conf and it will work."




Klaar met lezen? Je kunt naar het OVERZICHT van alle statistische onderwerpen op deze wiki gaan of naar de pagina KEUZE TOETS voor hulp bij het uitzoeken van een geschikte toets of analyse. Wil je meer leren over biostatistiek? Volg dan de AMC e-learning Practical Biostatistics. Vind je op deze pagina's iets dat niet klopt? Werkt een link niet? Of wil je bijdragen aan de wiki? Neem dan contact met ons op.

De wiki biostatistiek is een initiatief van de helpdesk statistiek van Amsterdam UMC, locatie AMC. Medewerkers van Amsterdam UMC, locatie AMC kunnen via intranet ondersteuning aanvragen. Ondersteuning aan studenten of derden is niet mogelijk.