Difference between revisions of "Statistiek rapporteren"

From Wikistatistiek
Jump to navigation Jump to search
(New page: {{auteurs| |mainauthor= ir. N. van Geloven |coauthor= }} ==Hoe rapporteer ik de de resultaten van niet significante bevindingen?== ''Momenteel zijn wij bezig me...)
 
 
(6 intermediate revisions by the same user not shown)
Line 1: Line 1:
 
{{auteurs|
 
{{auteurs|
|mainauthor= [[user:Nan van Geloven|ir. N. van Geloven]]
+
|mainauthor= [[user:Nan van Geloven|dr. ir. N. van Geloven]]
 
|coauthor=  
 
|coauthor=  
 
}}
 
}}
Line 8: Line 8:
 
''Momenteel zijn wij bezig met het opschrijven van een onderzoek waarbij wij logistische regressie hebben gebruikt. Er bestaat enige twijfel hoe wij deze uitkomsten het best kunnen noteren in het uiteindelijke artikel. Het gaat om de resultaten met een niet significante uitkomst waarbij we nu de p-waarde hebben genoteerd en daarbij de B waarde (wanneer significant noteren we OR en confidence interval).  
 
''Momenteel zijn wij bezig met het opschrijven van een onderzoek waarbij wij logistische regressie hebben gebruikt. Er bestaat enige twijfel hoe wij deze uitkomsten het best kunnen noteren in het uiteindelijke artikel. Het gaat om de resultaten met een niet significante uitkomst waarbij we nu de p-waarde hebben genoteerd en daarbij de B waarde (wanneer significant noteren we OR en confidence interval).  
  
Er zijn nog steeds veel verschillen in hoe de resultaten van statistische analyses worden getoond. Je zou de volgende insteek kunnen aanhouden: als je een tabel maakt met daarin de resultaten van je analyses, vermeld dan alle getoetste variabelen. Dus ook degenen die niet significant waren. Daarmee laat je duidelijk zien wat er in je model zat en iedereen die  later nog eens onderzoek wil doen naar die niet-significante factoren kan precies zien wat er uit jouw analyse kwam. Bij een logistische regressie is vermelding van de combinatie van OR - confidence interval - p-waarde vaak voldoende. De B staat in directe relatie tot de OR (OR=e^B, dakje betekent tot de macht), dus met de een kun je zelf altijd de ander berekenen.
+
Er zijn nog steeds veel verschillen in hoe de resultaten van statistische analyses worden getoond. Je zou de volgende insteek kunnen aanhouden: als je een tabel maakt met daarin de resultaten van je analyses, vermeld dan alle getoetste variabelen. Dus ook degenen die niet significant waren. Daarmee laat je duidelijk zien wat er in je model zat en iedereen die  later nog eens onderzoek wil doen naar die niet-significante factoren kan precies zien wat er uit jouw analyse kwam. Bij een [[logistische regressie]] is vermelding van de combinatie van OR - confidence interval - p-waarde vaak voldoende. De B staat in directe relatie tot de OR (OR=e^B, dakje betekent tot de macht), dus met de een kun je zelf altijd de ander berekenen.
 
Als je de resultaten uit de tabel ook bespreekt in de teksts, dan kun je de significante aanhalen met het getal erbij en de niet significante zonder getallen (die zijn op te zoeken in de tabel).  
 
Als je de resultaten uit de tabel ook bespreekt in de teksts, dan kun je de significante aanhalen met het getal erbij en de niet significante zonder getallen (die zijn op te zoeken in de tabel).  
  
 
Let wel op: sommige journals zijn heel streng op overlappende informatie in de tabel en de tekst. In dat geval kies je voor een van de twee manieren. Iig zou ik er voor zorgen dat ook de OR/conf int/p-waarde van niet-significante resultaten ergens genoemd staan.
 
Let wel op: sommige journals zijn heel streng op overlappende informatie in de tabel en de tekst. In dat geval kies je voor een van de twee manieren. Iig zou ik er voor zorgen dat ook de OR/conf int/p-waarde van niet-significante resultaten ergens genoemd staan.
  
 +
==Hoe rapporteer ik zeer kleine p waarden?==
  
==Referenties ==
+
''Van een reviewer kreeg ik de volgende vraag:
 +
 
 +
''Statistics are reported to be p=0.00 in several instances. Usually one chooses a priori the risk of a type I error by deciding that p < 0.05 will be considered statistically significant. Some authors report the actual p-value if less than 0.05 to signify a strong probability that the null hypothesis is wrong. If p values are to be reported the necessary number of didgits must be reported, e.g. p<0.001 or similar, but the p-value should not be abbreviated to 0.00 unless the test actually returns this value, highly unlikely.
 +
 
 +
''Wat kan ik het beste rapporteren?
 +
 
 +
In het algemeen is afronden ok, alleen als er dan 0.00 uitkomt is onduidelijk of dit bijv is 0.004 of 0.0000000000000000000000000000001 is oid. Het beste kun je zo'n getal rapporteren met meer cijfers achter de komma (0.004), of met bijv <0.001 wanneer er nog steeds nullen zijn op 3 cijfers achter de komma.
 +
 
 +
==Statistische richtlijnen van medische tijdschriften==
 +
 
 +
*[http://www.equator-network.org/reporting-guidelines/sampl/ The SAMPL Guidelines.] Basic Statistical Reporting for Articles Published in Biomedical Journals: The “Statistical Analyses and Methods in the Published Literature” or The SAMPL Guidelines
 +
*[http://www.consort-statement.org/ CONSORT statement] The CONsolidated Standards of Reporting Trials Statement is intended to improve the reporting of a randomized controlled trial (RCT), enabling readers to understand a trial's design, conduct, analysis and interpretation, and to assess the validity of its results
 +
*[http://www.equator-network.org/ The Equator Network] biedt alle laatste versies van guidelines behorend bij specifieke designs (meta-analyse, diagnostische studie, observationele studie etc.)
 +
*[http://www.editorialmanager.com/jtcvs/account/Statistical%20Release%20Statement.pdf Journal of Thoracic and cardiovascular surgery statistical release statement]
 +
*[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=22482869 The process of continuous journal improvement: new author guidelines for statistical and analytical reporting in VACCINE. Oberg AL, Poland GA. Vaccine. 2012 Apr 19;30(19):2915-7.]
 +
*[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/3082452 Gardner MJ, Machin D, Campbell MJ, “Use of Check Lists in Assessing the Statistical Content of Medical Studies” BMJ. 1986;292:810-2]
 +
*[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/3341656 Bailar JC, Mosteller F, “Guidelines for Statistical Reporting in Articles for Medical Journals” Ann Intern Med. 1988;108:226-73]
 +
 
 +
==Overige richtlijnen ==
  
 
*[http://www.ema.europa.eu/docs/en_GB/document_library/Scientific_guideline/2009/09/WC500002928.pdf ICH Topic E9 Statistical Principles for Clinical Trials] - Note for guidance on statistical principles for clinical trials (CPMP/ICH/363/96).  
 
*[http://www.ema.europa.eu/docs/en_GB/document_library/Scientific_guideline/2009/09/WC500002928.pdf ICH Topic E9 Statistical Principles for Clinical Trials] - Note for guidance on statistical principles for clinical trials (CPMP/ICH/363/96).  
*[http://dbem.ws/WritingArticle.pdf Writing the Empirical Journal Article, Daryl J. Bem] - Veel nuttige adviezen over wat er in een artikel moet staan. Ook adviezen over taalgebruik / vorm en over het beantwoorden van commentaar van reviewers.
+
*[http://www.writingcenter.uconn.edu/pdf/Writing_the_Empirical_Journal_Article_BEM.pdf Writing the Empirical Journal Article, Daryl J. Bem] - Veel nuttige adviezen over wat er in een artikel moet staan. Ook adviezen over taalgebruik / vorm en over het beantwoorden van commentaar van reviewers.
 
*[http://www.psiweb.org/docs/gsop.pdf Statisticians in the Pharmaceutical Industry: Guidelines For Standard Operating Procedures for Good Statistical Practice in Clinical Research] - Richtlijnen voor het volgens GCP standaarden uitvoeren en rapporteren van statistische analyses.
 
*[http://www.psiweb.org/docs/gsop.pdf Statisticians in the Pharmaceutical Industry: Guidelines For Standard Operating Procedures for Good Statistical Practice in Clinical Research] - Richtlijnen voor het volgens GCP standaarden uitvoeren en rapporteren van statistische analyses.
  
<div style="background-color:#e8f1ff; margin:0.5em; padding:1em; border:1px solid #C8D0DC;">
+
{{onderschrift}}
Terug naar [[OVERZICHT]] voor een overzicht van alle statistische onderwerpen op deze wiki.
 
 
 
Terug naar [[KEUZE TOETS]] voor hulp bij het uitzoeken van een geschikte toets of analyse.
 
<div>
 

Latest revision as of 21:23, 1 March 2014

Auteur dr. ir. N. van Geloven
Co-Auteur
auteurschap op deze site

Hoe rapporteer ik de de resultaten van niet significante bevindingen?

Momenteel zijn wij bezig met het opschrijven van een onderzoek waarbij wij logistische regressie hebben gebruikt. Er bestaat enige twijfel hoe wij deze uitkomsten het best kunnen noteren in het uiteindelijke artikel. Het gaat om de resultaten met een niet significante uitkomst waarbij we nu de p-waarde hebben genoteerd en daarbij de B waarde (wanneer significant noteren we OR en confidence interval).

Er zijn nog steeds veel verschillen in hoe de resultaten van statistische analyses worden getoond. Je zou de volgende insteek kunnen aanhouden: als je een tabel maakt met daarin de resultaten van je analyses, vermeld dan alle getoetste variabelen. Dus ook degenen die niet significant waren. Daarmee laat je duidelijk zien wat er in je model zat en iedereen die later nog eens onderzoek wil doen naar die niet-significante factoren kan precies zien wat er uit jouw analyse kwam. Bij een logistische regressie is vermelding van de combinatie van OR - confidence interval - p-waarde vaak voldoende. De B staat in directe relatie tot de OR (OR=e^B, dakje betekent tot de macht), dus met de een kun je zelf altijd de ander berekenen. Als je de resultaten uit de tabel ook bespreekt in de teksts, dan kun je de significante aanhalen met het getal erbij en de niet significante zonder getallen (die zijn op te zoeken in de tabel).

Let wel op: sommige journals zijn heel streng op overlappende informatie in de tabel en de tekst. In dat geval kies je voor een van de twee manieren. Iig zou ik er voor zorgen dat ook de OR/conf int/p-waarde van niet-significante resultaten ergens genoemd staan.

Hoe rapporteer ik zeer kleine p waarden?

Van een reviewer kreeg ik de volgende vraag:

Statistics are reported to be p=0.00 in several instances. Usually one chooses a priori the risk of a type I error by deciding that p < 0.05 will be considered statistically significant. Some authors report the actual p-value if less than 0.05 to signify a strong probability that the null hypothesis is wrong. If p values are to be reported the necessary number of didgits must be reported, e.g. p<0.001 or similar, but the p-value should not be abbreviated to 0.00 unless the test actually returns this value, highly unlikely.

Wat kan ik het beste rapporteren?

In het algemeen is afronden ok, alleen als er dan 0.00 uitkomt is onduidelijk of dit bijv is 0.004 of 0.0000000000000000000000000000001 is oid. Het beste kun je zo'n getal rapporteren met meer cijfers achter de komma (0.004), of met bijv <0.001 wanneer er nog steeds nullen zijn op 3 cijfers achter de komma.

Statistische richtlijnen van medische tijdschriften

Overige richtlijnen

Klaar met lezen? Je kunt naar het OVERZICHT van alle statistische onderwerpen op deze wiki gaan of naar de pagina KEUZE TOETS voor hulp bij het uitzoeken van een geschikte toets of analyse. Wil je meer leren over biostatistiek? Volg dan de AMC e-learning Practical Biostatistics. Vind je op deze pagina's iets dat niet klopt? Werkt een link niet? Of wil je bijdragen aan de wiki? Neem dan contact met ons op.

De wiki biostatistiek is een initiatief van de helpdesk statistiek van Amsterdam UMC, locatie AMC. Medewerkers van Amsterdam UMC, locatie AMC kunnen via intranet ondersteuning aanvragen. Ondersteuning aan studenten of derden is niet mogelijk!